【摘抄】量子化学计算中DFT泛函和基组的选择

前言

本文里凡是带DFT-D3校正的情况,如果你的程序支持DFT-D4,而且对相应的泛函定义了参数,那么都可以改用DFT-D4,对于有机类体系结果相对于DFT-D3不会有太大差别,但是对于计算过渡金属配合物的金属有机反应、弱相互作用的情况可能精度会有明显的改进。

计算能量相关问题的精度的顺序通常是:CCSD(T)>双杂化泛函>恰当选用的普通泛函>MP2>HF>半经验方法。

【重要】有机化学计算工具箱

感觉课题那边写的东西越来越多,已经超过这边的内容了,这边就改为工具箱,讲些软件相关的基础吧。

软件基础?

安装与调整

Error:本博客推荐的软件仅代表极少数,请根据自己喜好配置

需要安装的包括:服务器相关的上传和命令软件和化学结构绘制查看软件。

【摘抄】过渡态相关

本文来源:http://sobereva.com/44

采用BO近似简化体系

本质上,电子、原子核的运动是相关而不可分割的,求解薛定谔方程得到的是描述二者状态的总波函数和体系的总能量。在量子化学中,为简化问题,一般采用BO(Born-Oppenheimer)近似。由于电子比原子核轻得多,其运动速度远快于原子核,核坐标改变过程中的每一时刻电子的状态可以立即调整以使能量最低,而以电子的视角看原子核就是不动的势场,所以有理由将原子核运动与电子的运动分离开来。可以在每一组确定的核坐标情况下求解电子的薛定谔方程,电子能量加上核间互斥能即得到此几何结构下的分子总能量。这种BO近似的做法由于在求解电子薛定谔方程时忽略了核运动,所以也称为核不动近似。在BO近似下分子的能量是核坐标的函数,系统地变化核坐标,随之变化的能量就构成了势能面。