【摘抄】使用基组和赝势

基本概念

基组(basis set)

在量子化学中,基组是指用来描述体系波函数的一组数学函数。

斯莱特型轨道(Slater-Type Orbital,STO)

指的是用斯莱特型函数模拟原子轨道,用斯莱特型函数构成的基组具有明确的物理意义,能够较好的描述电子云的特征,缺点是在计算多中心双电子积分时,计算量很大。

【摘抄】Gaussian L9999问题(不收敛问题的解决方法)

L9999报错运行情况

一般来讲,L9999出现时大多运行到当前运行状态的最后的part还未收敛造成的。

输出文件一般都有点大(行数会比较超规格)

https://img.chukogals.top/73036195_1.pnghttps://img.chukogals.top/73036195_1.png

比如上图,因为循环了太多次,算到20万行了(输出文件也有14M,正常情况在10M以下)。

特征行:Error termination via Lnk1e in l9999.exe

【摘抄】在Gaussian 16计算中使用GPU

原文:https://mp.weixin.qq.com/s/KI3iLC7ko1Fn_ZdSKx_aeQ

本文介绍如何在G16中使用GPU来加速计算。本文内容是笔者阅读了Gaussian官网关于使用GPU的说明后,按自己的理解写下的,所以有些地方不能保证十分的严谨或正确,只能说是一种参考。官网网页或其他更为详细的参考资料请参见文末。

【摘抄】寻找过渡态的一些经验

要是有一套成熟的自动化程序能帮我找到我想要的过渡态就好了。可惜我还没有找到过,只能自己不断地摸索。下面是我在寻找过渡态的过程中的一些经验。

按照下面的步骤寻找过渡态,虽然可能比较耗费核时,但是经个人尝试,可以找到不少难找的过渡态。

【摘抄】Gaussian、ORCA使用笔记

关键词的选择

关于各种理论和方法的实现细节,我一点都算不上了解。有兴趣的可以参考 Sobereva 的《过渡态、反应路径的计算方法及相关问题》。总得来说,寻找过渡态时,应优先考虑这样的关键词,而不要轻易尝试 QST2、QST3:

# opt=(TS,calcfc,noeigen) freq

同时,如果你的体系里溶剂化效应非常明显,也请记得加上溶剂化,因为溶剂化模型会改变势能面的形状,程度随体系而变。一般来说我们最常用的是 SMD 模型。但是有时由于 SMD 模型的背景噪音,会导致在过渡态搜索的时候一直不收敛,或者在同一振动路径上能收敛出多个结构。拿这样算出来的结构去算 IRC 一定是跑不出来的,应该尝试将溶剂化模型换为默认的 IEFPCM 重新算过渡态和 IRC。