背景介绍
势能面扫描可用于研究一个区域内的势能面,通常是在不同结构上执行一系列的单点能计算,得到能量或其他性质随几何结构变化的情况。势能面扫描分以下两种类型:
刚性扫描 (rigid scan)
只改变被扫描的变量,而分子内其他变量固定不变,对分子进行一系列的单点能计算。
柔性扫描 (relaxed scan)
改变被扫描的变量,在每个结构处固定当前变量,并优化分子结构(实际是一个限制性优化)。
本篇先介绍刚性扫描的做法。刚性扫描使用scan关键词,与一般计算不同的是必须使用内坐标 (internal coordinate) 或称Z-matrix来描述分子结构。首先介绍一下内坐标的书写方法。